Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB1P20618 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB1P20618 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms