Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRHP20396 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRHP20396 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRHP20396 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRHP20396 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TRHP20396 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRHP20396 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRHP20396 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRHP20396 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRHP20396 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRHP20396 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRHP20396 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TRHP20396 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRHP20396 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRHP20396 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRHP20396 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRHP20396 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TRHP20396 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRHP20396 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRHP20396 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRHP20396 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRHP20396 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRHP20396 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRHP20396 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRHP20396 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRHP20396 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRHP20396 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRHP20396 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRHP20396 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRHP20396 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TRHP20396 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRHP20396 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRHP20396 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRHP20396 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRHP20396 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TRHP20396 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TRHP20396 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRHP20396 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRHP20396 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRHP20396 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRHP20396 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TRHP20396 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TRHP20396 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms