Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB4P17483 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB4P17483 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms