Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXB9P17482 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms