Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFAP15692 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms