Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM27P14373 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms