Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKAP2O75563 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms