Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F6O75461 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F6O75461 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F6O75461 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F6O75461 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms