Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSVO60911 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTSVO60911 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSVO60911 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSVO60911 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSVO60911 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSVO60911 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSVO60911 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSVO60911 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSVO60911 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTSVO60911 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTSVO60911 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTSVO60911 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms