Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPLO60437 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPLO60437 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPLO60437 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPLO60437 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPLO60437 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPLO60437 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPLO60437 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPLO60437 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPLO60437 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
PPLO60437 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPLO60437 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPLO60437 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPLO60437 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPLO60437 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPLO60437 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPLO60437 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPLO60437 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPLO60437 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPLO60437 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPLO60437 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPLO60437 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PPLO60437 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPLO60437 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPLO60437 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPLO60437 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms