Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms