Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IKBKBO14920 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms