Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
I3L4J1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
I3L4J1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
I3L4J1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
I3L4J1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
I3L4J1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
I3L4J1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
I3L4J1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
I3L4J1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
I3L4J1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
I3L4J1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
I3L4J1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms