Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C1D1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C1D1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C1D1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C1D1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C1D1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H7C1D1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C1D1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C1D1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C1D1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C1D1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
H7C1D1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms