Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF3BA8MYP8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF3BA8MYP8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms