Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CYSRT1A8MQ03 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms