Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNX8Q9Y5X2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms