Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms