Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TRAPPC8Q9Y2L5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms