Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms