Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
L1RE1Q9UN81 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms