Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSL6Q9UKU0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSL6Q9UKU0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms