Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PACSIN3Q9UKS6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms