Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COPS7AQ9UBW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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