Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CCDC180Q9P1Z9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CCDC180Q9P1Z9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CCDC180Q9P1Z9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms