Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms