Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIS18AQ9NYP9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MIS18AQ9NYP9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms