Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D2Q9NY47 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms