Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms