Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms