Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMPRSS4Q9NRS4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms