Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARHGEF3Q9NR81 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARHGEF3Q9NR81 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms