Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Praf2Q9JIG8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Praf2Q9JIG8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms