Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF541Q9H0D2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms