Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4CQ9C0C4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4CQ9C0C4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms