Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM6Q9C030 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms