Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMCQ9BYG8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms