Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CICQ96RK0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms