Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCLT1Q96NL6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCLT1Q96NL6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms