Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTV1Q96GA3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms