Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFHD2Q96C19 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD2Q96C19 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms