Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMIGD2Q96BF3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMIGD2Q96BF3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms