Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNPO1Q92973 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms