Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms