Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSH3Q8TE77 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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