Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC4Q8TBB5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC4Q8TBB5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms