Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms