Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00301Q8NCQ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms