Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP38Q8NB14 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP38Q8NB14 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms