Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP12Q6UXS9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms